Forskare inom växt-RNA-biologi

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.
Ämnesbeskrivning
Växter har en fantastisk förmåga att hantera miljöutmaningar genom intracellulär reglering av sina funktioner. Även om mycket uppmärksamhet tidigare har riktats mot de gener som kodar för proteiner, är växtgenom omfattande och innehåller till stor del icke-kodande DNA vars funktionella roll i cellerna är oklar. Vår tidigare forskning har visat hur växternas icke-kodande genom bidrar till cellernas motståndskraft genom produktion av icke-kodande RNA-molekyler, eller genom kromatinsignaturer som korrelerar med produktionen av icke-kodande RNA.
Vi söker en forskare som är entusiastisk över mekanistisk växtmolekylärbiologi inom detta område. Mer specifikt för att undersöka hur kromatinsignaturer kopplade till ncRNA-produktion kan hämma geninduktion (DOI: 10.1016/j.tplants.2020.03.005 , DOI: 10.1371/journal.pgen.1007969). Som utgångspunkt har vi isolerat mutanter i kromatinmodifierande vägar som stör denna mekanism.
Forskaren inom RNA-biologi kommer att arbeta med ett projekt där vi har kartlagt 5'-ändpositionerna för RNA-polymeras II:s initiering, de så kallade transkriptionsstartpunkterna (TSS), genomomfattande (dvs. med hjälp av STRIPE-seq). Vi fokuserade våra analyser på kromatinmutanter som resulterar i induktion av TSS på positioner där de vanligtvis undertrycks, framför allt i regioner där RNA-polymeras II förlänger, såsom i genkroppar. I kombination med direkt RNA-sekvensering med hjälp av Oxford nanopores har vi identifierat fascinerande exempel på genreglering, där TSS som induceras i kromatinmutanter undviker negativa effekter av alternativ polyadenylering (APA) i introner som förhindrar bildandet av mRNA i full längd.
Din roll i den inledande fasen av detta projekt kommer att vara att utgå från dessa befintliga data och slutföra återstående analyser, generera och analysera CRISPR/Cas9-medierade deletioner vid mållokaler samt driva på publiceringen av detta projekt.
Arbetsuppgifter
Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna, såsom:
Forskning inom växt-RNA-biologi
Undervisning på grund-, master- och forskarutbildningsnivå
Handledning av examensarbeten och doktorander
Aktivt sökande av extern forskningsfinansiering
Samarbete med näringslivet och samhället i stort
Administrativa uppgifter relaterade till ovanstående arbetsuppgifter

Kvalifikationskrav
Sökande måste ha:
En doktorsexamen eller motsvarande forskarutbildning inom tjänstens ämnesområde.
Gedigen bakgrund inom molekylär växtbiologi, särskilt RNA-biologi, till exempel anpassade protokoll för nästa generations bibliotek.
Mycket goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska.
Utmärkt förmåga att självständigt utveckla och bedriva högkvalitativ, nyfikenhetsdriven forskning.

Meriterande för anställningen
Kunskaper i analys av nästa generations sekvensering, till exempel med hjälp av högpresterande databehandling, R och Python.
Intresse och passion för det beskrivna forskningsprojektet inom växt-RNA-biologi
Egenmotivation
Uthållighet
Resultatinriktad med målet att slutföra projekt för publicering

Hänsyn kommer även att tas till god samarbetsförmåga, drivkraft och självständighet, samt hur sökandens erfarenhet och kompetens kompletterar och stärker den pågående forskningen inom institutionen och hur den kan bidra till dess framtida utveckling.
Anställningsvillkor
Det är en heltidsanställning som är tidsbegränsad på 1år. Tjänsten tillträds så snart som möjligt.
Kontaktperson: Sebastian Marquardt (andreas_sebastian.marquardt@biol.lu.se).
Instruktioner för ansökan
Ansökningarna ska skrivas på engelska och sammanställas i en PDF-fil som innehåller:
meritförteckning/CV, inklusive en publikationslista,
en allmän beskrivning av tidigare forskning och framtida forskningsintressen (högst tre sidor),
kontaktuppgifter till minst två referenser,
kopia av examensbeviset för doktorsexamen samt övriga intyg/betyg som du vill ska beaktas.

Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom astronomi, biologi fysik, geovetenskap, kemi, matematik, medicinsk strålningsfysik, miljövetenskap och naturgeografi. Verksamheten bedrivs inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1 900 studenter, 330 forskarstuderande och 730 anställda.
Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.