Postdoktor

Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi
Huvudsakliga arbetsuppgifterDesigna, genomföra och optimera Cell Painting‑experiment i leukemicellinjer och primära patientprover, inklusive behandling med substanser och lämpliga kontroller.Utveckla och underhålla bildanalys‑pipelines (CellProfiler, Python/R) för extraktion, kvalitetskontroll och analys av morfologiska single‑cell‑features samt koppla dessa till TP53‑genotyp och kliniska data.Integrera bilddata med genomiska, transkriptomiska och MRD‑analyser (Nanopore‑sekvensering, superRCA, panel‑NGS) för att definiera TP53‑beroende fenotyper och läkemedelssvar.Bidra till metodutveckling för applicering av Cell Painting på suspenderade celler samt till maskininlärningsmodeller för klassificering av TP53‑varianter.
Specifika ansvarsområden och beslutsbefogenheterAnsvara för planering av experiment och analyser inom Cell Painting–TP53‑arbetspaketet, inklusive val av TP53‑varianter, cellmodeller och experimentella betingelser.Fatta självständiga beslut kring optimering av protokoll, feature‑urval och datorbaserade arbetsflöden, i samråd med PI.Säkerställa datakvalitet, dokumentation och reproducerbarhet samt ha en ledande roll i utarbetande av manuskript, presentationer och metodbeskrivningar inom projektet.
Kvalifikationer och kompetenskravDoktorsexamen i cell- eller molekylärbiologi, biomedicinska vetenskaper eller annat närliggande område, med en tydlig kvantitativ eller datorbaserad inriktning eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i detsamma. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.Dokumenterad praktisk erfarenhet av arbete med däggdjurscellkultur, företrädesvis inklusive hematopoetiska eller leukemimodeller och funktionella analyser (t.ex. läkemedelssvar, apoptos, DNA‑skada).Visad expertis inom höginnehållsbaserad avbildning eller Cell Painting, inklusive experimentell design, färgningsprotokoll och grundläggande bildförvärv.Stark bioinformatisk kompetens med dokumenterad erfarenhet av Python och/eller R för storskalig dataanalys, statistiska analyser och visualisering.Erfarenhet av bearbetning av bildbaserade features (t.ex. output från CellProfiler), dimensionsreduktion, klustring samt klassificering baserad på maskininlärning.God kännedom om NGS‑baserad genomik eller transkriptomik (variantidentifiering, RNA‑sekvensering, single‑cell‑ eller bulk‑analyser) samt integration av multi‑omikdata är starkt meriterande.Mycket god publikationsmeritering i förhållande till karriärstadium, inklusive minst en försteförfattad artikel med kvantitativ eller bildbaserad analys.God problemlösningsförmåga, förmåga att arbeta självständigt samt stark motivation att driva ett multidisciplinärt projekt i gränslandet mellan leukemibiologi och datorbaserad analys.Samarbetsinriktad inställning, god kommunikationsförmåga och vilja att arbeta nära experimentella, kliniska och beräkningsinriktade samarbetspartners.Hög grad av noggrannhet och vetenskaplig stringens samt stort engagemang för utveckling av nya analytiska metoder och för att omsätta forskningsresultat i precisionsmedicin inom leukemi.
Om anställningen Anställningen är tidsbegränsad i 2 år enligt centralt kollektivavtal med möjlighet till 1 års förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Thierry Soussi, thierry.soussi@igp.uu.se, Panagiotis Baliakas, panagiotis.baliakas@igp.uu.se
Välkommen med din ansökan senast den 28 maj 2026, UFV-PA 2026/1384
Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att se den fullständiga annonsen vänligen klicka på ”Ansök här” eller se Uppsala universitets hemsida: https://uu.se/jobb/
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitethttps://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se

Öppen för alla
Vi fokuserar på din kompetens, inte dina övriga förutsättningar. Vi är öppna för att anpassa rollen eller arbetsplatsen efter dina behov.